Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.07■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.07■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.05■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4931428L18RikQ9D4S9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4931428L18RikQ9D4S9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.05■□□□□ -0
4931428L18RikQ9D4S9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4931428L18RikQ9D4S9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.05■□□□□ -0
4931428L18RikQ9D4S9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4931428L18RikQ9D4S9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4931428L18RikQ9D4S9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4931428L18RikQ9D4S9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4931428L18RikQ9D4S9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4931428L18RikQ9D4S9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
4931428L18RikQ9D4S9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4931428L18RikQ9D4S9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4931428L18RikQ9D4S9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4931428L18RikQ9D4S9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4931428L18RikQ9D4S9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.04■□□□□ -0
4931428L18RikQ9D4S9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4931428L18RikQ9D4S9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4931428L18RikQ9D4S9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4931428L18RikQ9D4S9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4931428L18RikQ9D4S9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4931428L18RikQ9D4S9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4931428L18RikQ9D4S9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.04■□□□□ -0
4931428L18RikQ9D4S9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.04■□□□□ -0
4931428L18RikQ9D4S9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4931428L18RikQ9D4S9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4931428L18RikQ9D4S9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4931428L18RikQ9D4S9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4931428L18RikQ9D4S9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4931428L18RikQ9D4S9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4931428L18RikQ9D4S9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
4931428L18RikQ9D4S9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
4931428L18RikQ9D4S9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4931428L18RikQ9D4S9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.03■□□□□ -0
4931428L18RikQ9D4S9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4931428L18RikQ9D4S9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
4931428L18RikQ9D4S9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
4931428L18RikQ9D4S9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
4931428L18RikQ9D4S9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4931428L18RikQ9D4S9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
4931428L18RikQ9D4S9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
4931428L18RikQ9D4S9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
4931428L18RikQ9D4S9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.03■□□□□ -0
4931428L18RikQ9D4S9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4931428L18RikQ9D4S9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4931428L18RikQ9D4S9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4931428L18RikQ9D4S9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4931428L18RikQ9D4S9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4931428L18RikQ9D4S9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4931428L18RikQ9D4S9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
4931428L18RikQ9D4S9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
4931428L18RikQ9D4S9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4931428L18RikQ9D4S9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
4931428L18RikQ9D4S9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.02■□□□□ -0
4931428L18RikQ9D4S9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.02■□□□□ -0
4931428L18RikQ9D4S9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms