Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clvs1Q9D4C9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clvs1Q9D4C9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clvs1Q9D4C9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clvs1Q9D4C9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clvs1Q9D4C9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Clvs1Q9D4C9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms