Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed11Q9D2R4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed11Q9D2R4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed11Q9D2R4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed11Q9D2R4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed11Q9D2R4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed11Q9D2R4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed11Q9D2R4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed11Q9D2R4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed11Q9D2R4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed11Q9D2R4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed11Q9D2R4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tmed11Q9D2R4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Tmed11Q9D2R4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed11Q9D2R4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms