Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nol3Q9D1X0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms