Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0T1

Snu13, NHP2-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snu13Q9D0T1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snu13Q9D0T1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snu13Q9D0T1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snu13Q9D0T1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snu13Q9D0T1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snu13Q9D0T1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snu13Q9D0T1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snu13Q9D0T1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snu13Q9D0T1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snu13Q9D0T1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snu13Q9D0T1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snu13Q9D0T1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snu13Q9D0T1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snu13Q9D0T1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Snu13Q9D0T1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snu13Q9D0T1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snu13Q9D0T1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snu13Q9D0T1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snu13Q9D0T1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snu13Q9D0T1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snu13Q9D0T1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snu13Q9D0T1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snu13Q9D0T1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snu13Q9D0T1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snu13Q9D0T1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snu13Q9D0T1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snu13Q9D0T1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snu13Q9D0T1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snu13Q9D0T1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snu13Q9D0T1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snu13Q9D0T1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snu13Q9D0T1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snu13Q9D0T1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snu13Q9D0T1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snu13Q9D0T1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snu13Q9D0T1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snu13Q9D0T1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snu13Q9D0T1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snu13Q9D0T1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snu13Q9D0T1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snu13Q9D0T1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snu13Q9D0T1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snu13Q9D0T1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snu13Q9D0T1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snu13Q9D0T1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snu13Q9D0T1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snu13Q9D0T1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snu13Q9D0T1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snu13Q9D0T1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.1 ms