Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mis12Q9CY25 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mis12Q9CY25 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mis12Q9CY25 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mis12Q9CY25 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mis12Q9CY25 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mis12Q9CY25 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mis12Q9CY25 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mis12Q9CY25 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mis12Q9CY25 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mis12Q9CY25 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Mis12Q9CY25 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mis12Q9CY25 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mis12Q9CY25 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mis12Q9CY25 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mis12Q9CY25 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Mis12Q9CY25 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mis12Q9CY25 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mis12Q9CY25 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mis12Q9CY25 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mis12Q9CY25 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mis12Q9CY25 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mis12Q9CY25 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mis12Q9CY25 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mis12Q9CY25 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mis12Q9CY25 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mis12Q9CY25 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mis12Q9CY25 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mis12Q9CY25 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mis12Q9CY25 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mis12Q9CY25 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mis12Q9CY25 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mis12Q9CY25 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mis12Q9CY25 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mis12Q9CY25 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mis12Q9CY25 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mis12Q9CY25 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mis12Q9CY25 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mis12Q9CY25 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Mis12Q9CY25 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Mis12Q9CY25 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mis12Q9CY25 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mis12Q9CY25 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mis12Q9CY25 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Mis12Q9CY25 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Mis12Q9CY25 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms