Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RpainQ9CWY9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RpainQ9CWY9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms