Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smurf1Q9CUN6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smurf1Q9CUN6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms