Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms