Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim8Q9CQQ0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim8Q9CQQ0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim8Q9CQQ0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim8Q9CQQ0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim8Q9CQQ0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim8Q9CQQ0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim8Q9CQQ0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim8Q9CQQ0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim8Q9CQQ0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim8Q9CQQ0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim8Q9CQQ0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim8Q9CQQ0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim8Q9CQQ0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim8Q9CQQ0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim8Q9CQQ0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim8Q9CQQ0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim8Q9CQQ0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim8Q9CQQ0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim8Q9CQQ0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim8Q9CQQ0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim8Q9CQQ0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim8Q9CQQ0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim8Q9CQQ0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim8Q9CQQ0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim8Q9CQQ0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms