Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trappc2Q9CQP2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc2Q9CQP2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc2Q9CQP2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc2Q9CQP2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc2Q9CQP2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc2Q9CQP2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc2Q9CQP2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc2Q9CQP2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc2Q9CQP2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc2Q9CQP2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc2Q9CQP2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc2Q9CQP2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc2Q9CQP2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc2Q9CQP2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc2Q9CQP2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc2Q9CQP2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms