Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms