Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ76

Nepn, Nephrocan, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NepnQ9CQ76 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NepnQ9CQ76 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms