Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ20

Mid1ip1, Mid1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1ip1Q9CQ20 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mid1ip1Q9CQ20 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mid1ip1Q9CQ20 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mid1ip1Q9CQ20 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mid1ip1Q9CQ20 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mid1ip1Q9CQ20 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mid1ip1Q9CQ20 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mid1ip1Q9CQ20 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mid1ip1Q9CQ20 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mid1ip1Q9CQ20 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mid1ip1Q9CQ20 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mid1ip1Q9CQ20 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Mid1ip1Q9CQ20 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Mid1ip1Q9CQ20 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mid1ip1Q9CQ20 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mid1ip1Q9CQ20 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mid1ip1Q9CQ20 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mid1ip1Q9CQ20 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mid1ip1Q9CQ20 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mid1ip1Q9CQ20 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mid1ip1Q9CQ20 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mid1ip1Q9CQ20 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mid1ip1Q9CQ20 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms