Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt88Q9CPR6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms