Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bhlhe41Q99PV5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms