Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brms1Q99N20 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Brms1Q99N20 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms