Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a4dQ99N05 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a4dQ99N05 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a4dQ99N05 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a4dQ99N05 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a4dQ99N05 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a4dQ99N05 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms