Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp1b1Q99LU0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms