Protein–RNA interactions for Protein: Q99JG7

Tnip2, TNFAIP3-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip2Q99JG7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnip2Q99JG7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms