Protein–RNA interactions for Protein: Q921I9

Exosc4, Exosome complex component RRP41, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc4Q921I9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Exosc4Q921I9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc4Q921I9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc4Q921I9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc4Q921I9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc4Q921I9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc4Q921I9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc4Q921I9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc4Q921I9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc4Q921I9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc4Q921I9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc4Q921I9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc4Q921I9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc4Q921I9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc4Q921I9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc4Q921I9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms