Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms