Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZP4

Slc5a4b, MCG3105, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4bQ91ZP4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc5a4bQ91ZP4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc5a4bQ91ZP4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc5a4bQ91ZP4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc5a4bQ91ZP4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc5a4bQ91ZP4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc5a4bQ91ZP4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc5a4bQ91ZP4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc5a4bQ91ZP4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc5a4bQ91ZP4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc5a4bQ91ZP4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc5a4bQ91ZP4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc5a4bQ91ZP4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc5a4bQ91ZP4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc5a4bQ91ZP4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc5a4bQ91ZP4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Slc5a4bQ91ZP4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Slc5a4bQ91ZP4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc5a4bQ91ZP4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc5a4bQ91ZP4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Slc5a4bQ91ZP4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc5a4bQ91ZP4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Slc5a4bQ91ZP4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc5a4bQ91ZP4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc5a4bQ91ZP4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Slc5a4bQ91ZP4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Slc5a4bQ91ZP4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Slc5a4bQ91ZP4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Slc5a4bQ91ZP4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc5a4bQ91ZP4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc5a4bQ91ZP4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc5a4bQ91ZP4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc5a4bQ91ZP4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc5a4bQ91ZP4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc5a4bQ91ZP4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc5a4bQ91ZP4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc5a4bQ91ZP4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc5a4bQ91ZP4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc5a4bQ91ZP4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc5a4bQ91ZP4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc5a4bQ91ZP4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms