Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD5

Cts3, Cathepsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts3Q91ZD5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cts3Q91ZD5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cts3Q91ZD5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms