Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Atl3Q91YH5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atl3Q91YH5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms