Protein–RNA interactions for Protein: Q91YE8

Synpo2, Synaptopodin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synpo2Q91YE8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Synpo2Q91YE8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Synpo2Q91YE8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Synpo2Q91YE8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Synpo2Q91YE8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Synpo2Q91YE8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Synpo2Q91YE8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Synpo2Q91YE8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Synpo2Q91YE8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Synpo2Q91YE8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Synpo2Q91YE8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Synpo2Q91YE8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Synpo2Q91YE8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Synpo2Q91YE8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Synpo2Q91YE8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Synpo2Q91YE8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Synpo2Q91YE8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Synpo2Q91YE8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Synpo2Q91YE8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Synpo2Q91YE8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Synpo2Q91YE8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Synpo2Q91YE8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Synpo2Q91YE8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Synpo2Q91YE8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Synpo2Q91YE8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Synpo2Q91YE8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Synpo2Q91YE8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Synpo2Q91YE8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Synpo2Q91YE8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Synpo2Q91YE8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Synpo2Q91YE8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Synpo2Q91YE8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Synpo2Q91YE8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Synpo2Q91YE8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Synpo2Q91YE8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Synpo2Q91YE8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Synpo2Q91YE8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Synpo2Q91YE8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Synpo2Q91YE8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Synpo2Q91YE8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Synpo2Q91YE8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Synpo2Q91YE8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Synpo2Q91YE8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Synpo2Q91YE8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Synpo2Q91YE8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Synpo2Q91YE8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Synpo2Q91YE8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Synpo2Q91YE8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Synpo2Q91YE8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Synpo2Q91YE8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Synpo2Q91YE8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Synpo2Q91YE8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Synpo2Q91YE8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Synpo2Q91YE8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Synpo2Q91YE8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Synpo2Q91YE8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Synpo2Q91YE8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Synpo2Q91YE8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Synpo2Q91YE8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Synpo2Q91YE8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Synpo2Q91YE8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Synpo2Q91YE8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Synpo2Q91YE8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Synpo2Q91YE8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Synpo2Q91YE8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Synpo2Q91YE8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Synpo2Q91YE8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Synpo2Q91YE8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Synpo2Q91YE8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Synpo2Q91YE8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Synpo2Q91YE8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Synpo2Q91YE8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Synpo2Q91YE8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Synpo2Q91YE8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Synpo2Q91YE8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Synpo2Q91YE8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Synpo2Q91YE8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Synpo2Q91YE8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Synpo2Q91YE8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Synpo2Q91YE8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Synpo2Q91YE8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Synpo2Q91YE8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Synpo2Q91YE8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Synpo2Q91YE8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Synpo2Q91YE8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Synpo2Q91YE8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Synpo2Q91YE8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Synpo2Q91YE8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Synpo2Q91YE8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Synpo2Q91YE8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Synpo2Q91YE8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Synpo2Q91YE8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Synpo2Q91YE8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Synpo2Q91YE8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Synpo2Q91YE8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Synpo2Q91YE8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Synpo2Q91YE8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Synpo2Q91YE8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Synpo2Q91YE8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Synpo2Q91YE8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms