Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Basp1Q91XV3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Basp1Q91XV3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms