Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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