Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU5

Snrk, SNF-related serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrkQ8VDU5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SnrkQ8VDU5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SnrkQ8VDU5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms