Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0F3

Sumf1, Sulfatase-modifying factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumf1Q8R0F3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sumf1Q8R0F3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sumf1Q8R0F3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms