Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ssh3Q8K330 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
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