Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW8

Pnma3, Paraneoplastic antigen Ma3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma3Q8JZW8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pnma3Q8JZW8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pnma3Q8JZW8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pnma3Q8JZW8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pnma3Q8JZW8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pnma3Q8JZW8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pnma3Q8JZW8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pnma3Q8JZW8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pnma3Q8JZW8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pnma3Q8JZW8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pnma3Q8JZW8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pnma3Q8JZW8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pnma3Q8JZW8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pnma3Q8JZW8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pnma3Q8JZW8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pnma3Q8JZW8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pnma3Q8JZW8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pnma3Q8JZW8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pnma3Q8JZW8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pnma3Q8JZW8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pnma3Q8JZW8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pnma3Q8JZW8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pnma3Q8JZW8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Pnma3Q8JZW8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Pnma3Q8JZW8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Pnma3Q8JZW8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pnma3Q8JZW8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pnma3Q8JZW8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms