Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW4

Cpne5, Copine-5, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne5Q8JZW4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne5Q8JZW4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne5Q8JZW4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms