Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY8

Dctn4, Dynactin subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn4Q8CBY8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dctn4Q8CBY8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms