Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms