Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Bhlhe22Q8C6A8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlhe22Q8C6A8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms