Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ube3dQ8BX13 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms