Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp398Q8BV16 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp398Q8BV16 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp398Q8BV16 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp398Q8BV16 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp398Q8BV16 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp398Q8BV16 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp398Q8BV16 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp398Q8BV16 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp398Q8BV16 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp398Q8BV16 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp398Q8BV16 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp398Q8BV16 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp398Q8BV16 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp398Q8BV16 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms