Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gga3Q8BMI3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gga3Q8BMI3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gga3Q8BMI3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gga3Q8BMI3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gga3Q8BMI3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gga3Q8BMI3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gga3Q8BMI3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gga3Q8BMI3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gga3Q8BMI3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gga3Q8BMI3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gga3Q8BMI3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gga3Q8BMI3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gga3Q8BMI3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gga3Q8BMI3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gga3Q8BMI3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gga3Q8BMI3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gga3Q8BMI3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gga3Q8BMI3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gga3Q8BMI3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gga3Q8BMI3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gga3Q8BMI3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gga3Q8BMI3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gga3Q8BMI3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gga3Q8BMI3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gga3Q8BMI3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gga3Q8BMI3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gga3Q8BMI3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gga3Q8BMI3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gga3Q8BMI3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gga3Q8BMI3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gga3Q8BMI3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gga3Q8BMI3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gga3Q8BMI3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gga3Q8BMI3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Gga3Q8BMI3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Gga3Q8BMI3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gga3Q8BMI3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gga3Q8BMI3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gga3Q8BMI3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gga3Q8BMI3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gga3Q8BMI3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gga3Q8BMI3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gga3Q8BMI3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
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