Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKU8

Tmem87b, Transmembrane protein 87B, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem87bQ8BKU8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem87bQ8BKU8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms