Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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H2-M10.4Q85ZW8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M10.4Q85ZW8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M10.4Q85ZW8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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