Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc50Q810U5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc50Q810U5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms