Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ6

Zer1, Protein zer-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zer1Q80ZJ6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zer1Q80ZJ6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zer1Q80ZJ6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zer1Q80ZJ6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zer1Q80ZJ6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zer1Q80ZJ6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zer1Q80ZJ6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zer1Q80ZJ6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zer1Q80ZJ6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zer1Q80ZJ6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zer1Q80ZJ6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zer1Q80ZJ6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zer1Q80ZJ6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zer1Q80ZJ6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zer1Q80ZJ6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zer1Q80ZJ6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zer1Q80ZJ6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zer1Q80ZJ6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zer1Q80ZJ6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zer1Q80ZJ6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zer1Q80ZJ6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zer1Q80ZJ6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zer1Q80ZJ6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zer1Q80ZJ6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zer1Q80ZJ6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zer1Q80ZJ6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zer1Q80ZJ6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zer1Q80ZJ6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zer1Q80ZJ6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zer1Q80ZJ6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zer1Q80ZJ6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zer1Q80ZJ6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zer1Q80ZJ6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zer1Q80ZJ6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Zer1Q80ZJ6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zer1Q80ZJ6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zer1Q80ZJ6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zer1Q80ZJ6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zer1Q80ZJ6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zer1Q80ZJ6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zer1Q80ZJ6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zer1Q80ZJ6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zer1Q80ZJ6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zer1Q80ZJ6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zer1Q80ZJ6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zer1Q80ZJ6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zer1Q80ZJ6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zer1Q80ZJ6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zer1Q80ZJ6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zer1Q80ZJ6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zer1Q80ZJ6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zer1Q80ZJ6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zer1Q80ZJ6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zer1Q80ZJ6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zer1Q80ZJ6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zer1Q80ZJ6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zer1Q80ZJ6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zer1Q80ZJ6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zer1Q80ZJ6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zer1Q80ZJ6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zer1Q80ZJ6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zer1Q80ZJ6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zer1Q80ZJ6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zer1Q80ZJ6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zer1Q80ZJ6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zer1Q80ZJ6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zer1Q80ZJ6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zer1Q80ZJ6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zer1Q80ZJ6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zer1Q80ZJ6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zer1Q80ZJ6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zer1Q80ZJ6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zer1Q80ZJ6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zer1Q80ZJ6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zer1Q80ZJ6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zer1Q80ZJ6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zer1Q80ZJ6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zer1Q80ZJ6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zer1Q80ZJ6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zer1Q80ZJ6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zer1Q80ZJ6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zer1Q80ZJ6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zer1Q80ZJ6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zer1Q80ZJ6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zer1Q80ZJ6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zer1Q80ZJ6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zer1Q80ZJ6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zer1Q80ZJ6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zer1Q80ZJ6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zer1Q80ZJ6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zer1Q80ZJ6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zer1Q80ZJ6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zer1Q80ZJ6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zer1Q80ZJ6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zer1Q80ZJ6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zer1Q80ZJ6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zer1Q80ZJ6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zer1Q80ZJ6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zer1Q80ZJ6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zer1Q80ZJ6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms