Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Amigo1Q80ZD8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Amigo1Q80ZD8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Amigo1Q80ZD8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Amigo1Q80ZD8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Amigo1Q80ZD8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Amigo1Q80ZD8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Amigo1Q80ZD8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Amigo1Q80ZD8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Amigo1Q80ZD8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Amigo1Q80ZD8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Amigo1Q80ZD8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Amigo1Q80ZD8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Amigo1Q80ZD8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Amigo1Q80ZD8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Amigo1Q80ZD8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Amigo1Q80ZD8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Amigo1Q80ZD8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Amigo1Q80ZD8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Amigo1Q80ZD8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Amigo1Q80ZD8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Amigo1Q80ZD8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Amigo1Q80ZD8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Amigo1Q80ZD8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Amigo1Q80ZD8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Amigo1Q80ZD8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Amigo1Q80ZD8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Amigo1Q80ZD8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Amigo1Q80ZD8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Amigo1Q80ZD8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Amigo1Q80ZD8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Amigo1Q80ZD8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Amigo1Q80ZD8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Amigo1Q80ZD8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Amigo1Q80ZD8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Amigo1Q80ZD8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Amigo1Q80ZD8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Amigo1Q80ZD8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Amigo1Q80ZD8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Amigo1Q80ZD8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Amigo1Q80ZD8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Amigo1Q80ZD8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Amigo1Q80ZD8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Amigo1Q80ZD8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Amigo1Q80ZD8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Amigo1Q80ZD8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Amigo1Q80ZD8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Amigo1Q80ZD8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Amigo1Q80ZD8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Amigo1Q80ZD8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Amigo1Q80ZD8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Amigo1Q80ZD8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Amigo1Q80ZD8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Amigo1Q80ZD8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Amigo1Q80ZD8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Amigo1Q80ZD8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Amigo1Q80ZD8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Amigo1Q80ZD8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Amigo1Q80ZD8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Amigo1Q80ZD8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Amigo1Q80ZD8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Amigo1Q80ZD8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Amigo1Q80ZD8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Amigo1Q80ZD8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Amigo1Q80ZD8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Amigo1Q80ZD8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Amigo1Q80ZD8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Amigo1Q80ZD8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Amigo1Q80ZD8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Amigo1Q80ZD8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Amigo1Q80ZD8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Amigo1Q80ZD8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Amigo1Q80ZD8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Amigo1Q80ZD8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Amigo1Q80ZD8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Amigo1Q80ZD8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Amigo1Q80ZD8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Amigo1Q80ZD8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Amigo1Q80ZD8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Amigo1Q80ZD8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Amigo1Q80ZD8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Amigo1Q80ZD8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
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