Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lamp3Q7TST5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lamp3Q7TST5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamp3Q7TST5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamp3Q7TST5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamp3Q7TST5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamp3Q7TST5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamp3Q7TST5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamp3Q7TST5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamp3Q7TST5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamp3Q7TST5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamp3Q7TST5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamp3Q7TST5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamp3Q7TST5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamp3Q7TST5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamp3Q7TST5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamp3Q7TST5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamp3Q7TST5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamp3Q7TST5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamp3Q7TST5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamp3Q7TST5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamp3Q7TST5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lamp3Q7TST5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lamp3Q7TST5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lamp3Q7TST5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lamp3Q7TST5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lamp3Q7TST5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lamp3Q7TST5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lamp3Q7TST5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lamp3Q7TST5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lamp3Q7TST5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lamp3Q7TST5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lamp3Q7TST5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lamp3Q7TST5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lamp3Q7TST5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lamp3Q7TST5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lamp3Q7TST5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lamp3Q7TST5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lamp3Q7TST5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lamp3Q7TST5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lamp3Q7TST5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lamp3Q7TST5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lamp3Q7TST5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lamp3Q7TST5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lamp3Q7TST5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lamp3Q7TST5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lamp3Q7TST5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Lamp3Q7TST5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lamp3Q7TST5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lamp3Q7TST5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lamp3Q7TST5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lamp3Q7TST5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lamp3Q7TST5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lamp3Q7TST5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lamp3Q7TST5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lamp3Q7TST5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lamp3Q7TST5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Lamp3Q7TST5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms