Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dsg1bQ7TSF1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg1bQ7TSF1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms