Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ckap2lQ7TS74 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ckap2lQ7TS74 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms