Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNL3

Stk40, Serine/threonine-protein kinase 40, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk40Q7TNL3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stk40Q7TNL3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stk40Q7TNL3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stk40Q7TNL3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stk40Q7TNL3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stk40Q7TNL3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stk40Q7TNL3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stk40Q7TNL3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stk40Q7TNL3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stk40Q7TNL3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stk40Q7TNL3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stk40Q7TNL3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stk40Q7TNL3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Stk40Q7TNL3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stk40Q7TNL3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Stk40Q7TNL3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stk40Q7TNL3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stk40Q7TNL3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stk40Q7TNL3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stk40Q7TNL3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stk40Q7TNL3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stk40Q7TNL3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stk40Q7TNL3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Stk40Q7TNL3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stk40Q7TNL3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stk40Q7TNL3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Stk40Q7TNL3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stk40Q7TNL3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stk40Q7TNL3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stk40Q7TNL3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stk40Q7TNL3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stk40Q7TNL3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stk40Q7TNL3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stk40Q7TNL3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stk40Q7TNL3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stk40Q7TNL3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stk40Q7TNL3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stk40Q7TNL3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stk40Q7TNL3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stk40Q7TNL3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stk40Q7TNL3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stk40Q7TNL3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stk40Q7TNL3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stk40Q7TNL3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Stk40Q7TNL3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Stk40Q7TNL3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Stk40Q7TNL3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Stk40Q7TNL3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Stk40Q7TNL3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Stk40Q7TNL3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Stk40Q7TNL3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Stk40Q7TNL3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Stk40Q7TNL3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Stk40Q7TNL3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Stk40Q7TNL3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Stk40Q7TNL3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Stk40Q7TNL3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stk40Q7TNL3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stk40Q7TNL3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stk40Q7TNL3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stk40Q7TNL3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stk40Q7TNL3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stk40Q7TNL3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stk40Q7TNL3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stk40Q7TNL3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stk40Q7TNL3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stk40Q7TNL3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stk40Q7TNL3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stk40Q7TNL3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stk40Q7TNL3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Stk40Q7TNL3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stk40Q7TNL3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stk40Q7TNL3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stk40Q7TNL3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stk40Q7TNL3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stk40Q7TNL3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stk40Q7TNL3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stk40Q7TNL3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Stk40Q7TNL3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stk40Q7TNL3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stk40Q7TNL3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Stk40Q7TNL3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stk40Q7TNL3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Stk40Q7TNL3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stk40Q7TNL3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Stk40Q7TNL3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Stk40Q7TNL3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stk40Q7TNL3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stk40Q7TNL3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stk40Q7TNL3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stk40Q7TNL3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stk40Q7TNL3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stk40Q7TNL3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Stk40Q7TNL3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stk40Q7TNL3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stk40Q7TNL3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stk40Q7TNL3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stk40Q7TNL3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stk40Q7TNL3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stk40Q7TNL3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms