Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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