Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Chsy1Q6ZQ11 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chsy1Q6ZQ11 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms